суббота, 4 июля 2009 г.

Шизофрения: новые результаты GWAS

В последнем номере Nature опубликованы три статьи с самыми свежими данными полногеномных анализов ассоциации шизофрении. Выборки составили в сумме около 8 000 пациентов и 19 000 контролей.
Результаты весьма скромные: только с помощью мета-анализа объединённой выборки удалось различить. 1. ассоциацию с участком 6p21 (где, помимо прочих, находятся гены MHC). 2. ассоциацию с двумя снипами в загадочных и мало кому известных генах NRGN и TCF4). Это конечно совсем не то, чего ожидали от генетических исследований психиатры... Ассоциацию с генами MHC, очевидно, при желании можно обнаружить для любой болезни (тем более что связь шизофрении с инфекционыными заболеваниями широко обсуждалась). А два снипа (из сотен тысяч) в непонятных генам наверняка "всплыли" случайно.
Радуют выводы Дэвида Коллиера, который пишет, что хорошо бы собрать 100 000 пациентов и столько же контролей. Ещё больше радуют выводы статистического анализа, согласно которым по данными о генотипах нескольких тысяч снипов можно объяснить 3% (три! процента) вариабельности между выборками.
Мне кажется гораздо более ценной точка зрения, высказанная в комментариях. Даниэль Вайнбергер пишет, что даже для соматических заболеваний, таких как диабет, или для такого фенотипа как повышенное давление, существует много разнообразных факторов, вносящих свой вклад в фенотип. Что уж говорить о психических заболеваниях? При обследовании огромной выборки эффект каждого из этих факторов вероятнее всего нивелируется.
Что может быть более перспективным? Анализ небольших, но хорошо охарактеризованнных выборок. Анализ семей. Исследования физиологических механизмов шизофрении.

http://www.schizophreniaforum.org/new/detail.asp?id=1532

Комментариев нет:

Отправить комментарий